
Los efectos secundarios de los probióticos, si ocurren, tienden a ser suaves y se limitan a problemas digestivos (por ejemplo gas o sensacion de llenura). Los probióticos pueden causar teóricamente infecciones que necesitarian ser tratadas con antibióticos, especialmente en gente con condiciones de salud subyacentes. Podrían también causar actividades metabólicas malsanas, demasiado estímulo del sistema inmune, o la transferencia de material genetico (mediante la inserción del material genético en una célula).
Los productos probióticos tomados por via oral como un producto dietético suplementario son regulado por la Agencia Federal de Drogas y Alimentos (FDA) en los Estados Unidos y tiene requisitos de etiquetado especiales como suplementos dietéticos y es regulado como alimentos, no drogas.
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